本中心宗旨為依據科技部及國防部以國防科技發展藍圖及國防部「先進科技研究計畫」之需求而成立本中心。本中心偕同國家實驗研究院台灣海洋科技研究中 心、國防大學理工學院、中信造船、台灣國際造船、金屬工業研究發展中心等， 共同組成開發聯盟，投入水下載具技術與設備系統研發，並支援國防部研發需求。
主要任務如下：
（一）培育創新產業發展所需之關鍵人才。
（二）提升國內海洋研究開發能量。
（三）軍事科技研發以及水下救援。
（四）支援軍方聯合演訓。